面，如果转基因作物的相关基因向亲缘野生种转移，就会污染到整个种子资源基因库，从而改变区域性植物基因，甚至是全球性植物基因，这将会对生态环境造成巨大危害。

并且，人类也是自然生态系统中的一部分，人们担心，这些转基因植物很可能还会危及到部分已植物喂食的动物基因，最终影响人类基因。