一招确实收到了效果。当京都的日寇守将听闻织田信长大军被全歼，连织田信长都失踪的消息之后，心里大骇不已。接着，明军大军压城，攻城站迫在眉睫。在他看来，明军等的也正是这一消息，织田信长的主力被歼灭之后，明军已无后顾之忧，所以可以集中兵力攻城。

日寇守将三思之后，终于做出了一个将影响后世数百年的决定：投降！在日本历史上，这个不知名的日寇将领（明史，日本史中都无记载，只是含糊的说了一句是个普通的军官而已，还不是将军）的决定引起了很大的争论。有人认为，他如果再坚持守上几日，把消息送给织田信长的话，那么神户一战的结果就将完全不一样，到时候明军的计划就将完全失败。同样的，也有人认为，他投降与否其实并没有太大的关系，以当时明军队实力来讲，打下京都是不成任何问题的。当然，也正是这名日寇的将领选择了投降，这才没有让京都在战火中化为一片废墟（不过后来还是避免不了的被明军炸成了废墟），保持了日本的首都，不然的话，这座有着上千年历史的城市就将彻底的从地球上消失了！

日寇主动投降，严广儒松了口气，立即派兵入城，收缴了日寇武装。而此时，朱祁钰严禁滥杀无辜的命令也早就传了过来，严广儒自然不敢乱杀一人，将日寇，以及城内的日本人都集中看管了起来。而在此之前，他已经派人以最快的速度去通知陈懋，邓茂，以及卫平，报告占领京都的消息。

只不过，此时神户已经被彻底围困，严广儒派出的军官没有能够直接进入神户，而是在海边绕了一圈，找到了李舜臣的舰队，这才让李舜臣把消息带给了卫平。也正是如此，明军占领京都的消息晚了几个时辰送到卫平这边来。当卫平接到消息的时候，织田信长也已经从那些偷偷逃出京都，不肯向明军投降的日寇那里得知了京都沦陷的消息。

织田信长此时是没有选择的。他一直认为明军的步兵军都集中在神户，现在他也认识到这个判断错了。明军还有一支强大的步兵军集中在了京都附近。现在京都已经沦陷，如果这支步兵军以最快的速度南下的话，他就将遭到夹击。无奈之下，织田信长只能撤出神户地区，返回大阪，并且一路退到了奈良城，准备在这里固守。另外，织田信长也没有忘记通知在福知山坚守的明智光秀，让他也撤退到敦贺一线，在若荚湾与琵琶湖之间组建新的防线。

可以说，陈懋这次组织的战役进攻打得