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这一年，朝廷下诏，命令士族中与非士族通婚的人都去补充将吏职位（充当兵役）。士族大多逃避兵役逃亡，朝廷于是制定严厉法令，抓到逃亡者就斩首，结果很多人逃到山林湖泊中当盗贼。沈怀文劝谏，孝武帝不听。

大明六年壬寅（公元462年）

春季，正月初八，北魏乐浪王拓跋万寿去世。

正月十六日，孝武帝首次在明堂祭祀五帝，宣布大赦。

正月初二，朝廷在中堂举行秀才、孝廉的策试。扬州秀才顾法的对策中说：“源头清澈，水流就洁净；君主圣明，刑法就完备。君主亲自推行教化，比自上而下的政令更有效；君主亲自示范训导，比风吹草倒的速度还快。”孝武帝看后，厌恶他的直言不讳，把策卷扔到地上。

二月初五，朝廷恢复文武百官的俸禄（此前可能因财政问题削减过）。

三月十一日，孝武帝立皇子刘子元为邵陵王。

起初，侍中沈怀文，多次因直言劝谏违背孝武帝的心意。沈怀文一向和颜竣、周朗关系好，孝武帝对他说：“颜竣如果早知道我会杀他，当初也不敢那样放肆。”沈怀文沉默不语。侍中王彧，在谈话中称赞颜竣、周朗的才华，沈怀文也跟着附和。颜师伯把这事告诉了孝武帝，孝武帝对沈怀文更加不满。

孝武帝曾外出射雉，突然遇到大风大雨。沈怀文和王彧、江智渊事先约定一起劝谏。恰逢孝武帝召他们进入射雉场，沈怀文说：“风雨这么大，陛下不宜冒雨停留。”王彧也说：“沈怀文的建议，陛下应该听从。”江智渊还没来得及说话，孝武帝就搭起弓箭，脸色大变说：“你想效仿颜竣吗？为什么总爱管闲事！”又说：“颜竣那小子，我真后悔没先抽他的脸！”

每次孝武帝设宴聚会，都要让在座的人喝得大醉，还毫无节制地嘲讽取乐。沈怀文一向不喝酒，也不喜欢玩笑戏谑，孝武帝认为他故意和自己作对。谢庄曾告诫沈怀文：“你总是和别人不一样，怎么能长久呢！”沈怀文说：“我从小就这样，怎么能一天之内改变！我不是故意要与众不同，是本性如此。”于是孝武帝把沈怀文外调为晋安王刘子勋的征虏长史，兼任广陵太守。

沈怀文到建康参加正月朝会，朝会结束后朝廷命他返回任所，他因女儿生病请求延长假期，到这时还没出发，被有关部门弹劾，免去官职，禁止做官十年。沈怀文卖掉宅院，想返回东边的家乡，孝武帝听说后，勃然大怒，把他逮捕交给廷尉。五月二十日，赐沈怀文死。沈怀文的三个儿子沈澹、沈渊、沈冲，一边走一边哭着为父亲求情，看到的人都为之感伤。柳元景想救沈怀文，对孝武帝说：“沈怀文的三个儿子处境悲惨，实在让人不忍心看；希望陛下尽快依法处置沈怀文。”（柳元景想委婉劝皇帝从轻，却没能如愿）孝武帝最终还是杀了沈怀文。

夏季，四月，殷淑仪去世。朝廷追封她为贵妃，谥号“宣”。孝武帝悲痛不已，精神恍惚，政务都荒废了不少。

五月十六日，太宰刘义恭辞去司徒职务。

六月初五，东昌文穆公刘延孙去世。

六月十四日，北魏国主前往阴山。

北魏石楼胡（少数民族）首领贺略孙反叛，长安镇将陆真讨伐并平定了叛乱。北魏国主命令陆真修筑长蛇镇。氐族豪强仇傉檀反叛，陆真又讨伐平定了他，最终完成筑城任务后返回。

秋季，七月十七日，北魏国主前往河西。

七月初十，孝武帝立皇子刘子云为晋陵王；当天刘子云去世，谥号“孝”。

起初，东晋庾冰提议让僧人向君主致敬，桓玄后来也重提这一建议，但都没落实。到这时，孝武帝让有关部门上奏说：“儒家、法家分支不同，名家、墨家条理有别，但在尊崇亲人、敬重君主方面，他们的主张没有偏差。只有佛教，违背经典、背离正统，拘泥文字而遮蔽正道，在民间轻率传播。佛教本应倡导谦卑自守、忠诚恭敬，哪有对僧人谦卑屈膝，却对父母轻慢无礼；对年长僧人叩拜，却对君主挺直身躯的道理呢！我们商议后认为，僧人接见君主时，应当尽显恭敬；礼仪姿态可依照佛教本俗。”九月十八日，朝廷规定僧人必须向君主致敬。等到废帝即位后，又恢复了旧制（僧人不用向君主致敬）。

九月二十五日，任命尚书右仆射刘遵考为左仆射，丹阳尹王僧朗为右仆射。王僧朗是王彧的父亲。

冬季，十月十三日，将宣贵妃殷氏安葬在龙山。为了凿山开路，修了几十里道路，百姓不堪劳役，死亡人数很多；自东晋渡江南迁以来，江南地区的葬礼规模，从没这么盛大过。孝武帝还为殷贵妃另建了一座祭庙。

北魏员外散骑常侍游明根等人前来南朝宋访问。

十月二十二日，加授尚书令柳元景为司空。十一月十三日，北魏国主返回平城。

南徐州从事史、范阳人祖冲之上书，指出何承天编撰的《元嘉历》还有很多疏漏错误，请求重新编制新历法。他认为：“旧历法中，冬至的太阳位置是固定的，但不到一百年，就会偏差二度；现在我制定的新历法，让冬至时太阳的位置每年略微变化，长期使用下去，无需频繁修改。此外，子是十二时辰的开端，位置在正北方，虚宿是北方星宿的中心；新历法的上元（历法推算的起始点）太阳位置，从虚宿一度开始。还有，日期的记法以甲子为首位；新历法的上元年份就定在甲子年。另外，何承天的历法中，太阳、月亮、五大