，这些学生没有军事才干，只是蒋经国派到军队中的监视者。当时的很多国民党军官对此不以为然，孙立人特别反对，他以美国军队没有这个体制为理由，强烈反对，但蒋经国以蒋介石为后台，坚持向军队委派干部，这场冲突以孙立人被监禁结束。

　　再次，为了化解与国民党军队将来的隔阂，也为了赢得将士爱戴，蒋经国确实下了很多工夫。他十分关注普通士兵的利益，经常下连队等基层单位，和广大士兵同吃、同住，时常到海防第一线访问。当江山岛被我军队攻击的时候，蒋经国以“政治部主任”的身份，坚持到最后一刻才撤离，这种临危不惧的拼命精神赢得了国民党士兵的佩服，也使很多老将看在眼里。最后，为了弥补蒋经国在军事上的外行，蒋介石刻意在军事上培植蒋纬国，这个蒋介石的小儿子早年在德国学习军事，主攻装甲车辆，二战之后，装甲战成为战争主流，装甲部队也成为设备质量最高的军种，蒋纬国在部队中担任实职，有力补充了大哥的不足。

　　就这样，通过蒋介石精心安排，也通过蒋经国自身的努力，这个从来没有打过仗的二级上将，终于在军队中站稳脚跟。

　　干部、特务和军队是蒋介石赖以发家的三大法宝，他手把手地将这三件法宝——交给儿子，终于使蒋家王朝的基业有了再续的根基。但蒋经国毕竟资历很浅，难以让众人服气，蒋经国从边缘到成为权力中心，还需要一番布置。

　　蒋介石选择cc系为第一个开刀对象。

　　蒋介石到台湾之后，就开始总结失败教训。他特别提出，“外交”、经济、军事、教育等方面的失败还不是最大的失败，最大的失败是政治上的失败，而导致政治失败的最重要原因是党的建设的失败。蒋介石认为国民党组织涣散，没有核心领导力量，到台湾之后仍然出现这种情况，派系斗争十分激烈。

　　其实国民党的派系斗争从来都没有停止过，蒋介石本人还鼓励派系斗争，以从中控制，他长期的政治谋略就是不允许一派坐大，使各个派系相互斗争，自己居中调停。在军事上陈诚和何应钦，财政上宋子文和孔祥熙斗个不停；党务方面的斗争最为激烈，二陈与朱家骅之间，cc系与复兴社之间；特务系统中中统和军统之间相互倾轧，在共产党的打击之下，最后土崩瓦解。蒋介石深感派系斗争的严重性，决心对国民党进行改造，消除异己力量，将国民党牢牢控制在蒋家手中。

　　因为cc系长期控制国民党，整顿国民党自然要从cc系看手。

　　cc系控制国民党凡20年，与蒋介石关系也非同寻常。陈氏兄弟是蒋介石大恩人陈其美的侄子，陈立夫跟蒋经国的关系也很好，当时蒋经国在上海读书的时候，蒋介石要求陈立夫照顾蒋经国，没有钱随时找陈立夫要，两家应该说是世交。但在cc系控制国民党的过程中，逐渐产生了巨大矛盾，这种矛盾的产生是从蒋介石培植蒋经国势力开始的。

　　蒋介石为了让儿子接自己的班，准备让蒋经国从控制党务着手，而党务是二陈的地盘，如果蒋经国进入党务系统，势必会使二陈的政治作用下降，二陈虽然感到难以与蒋介石对抗，但事关自己的政治生命，不得不进行抗争。1946年3月，蒋介石要陈果夫担任浙江省主席，以把位置腾挪出来，跟陈果夫说：“你做中央的事情做不好，你到地方一定能够做好。”谁知道陈果夫根本不买账，说：“你说谁在中央能把事情做好？”蒋介石被陈顶撞，心中气愤不已。

　　之后，蒋介石为了让蒋经国抓干部，特地派蒋经国到中央政治大学担任教育长，中央政治大学是二陈地盘，二陈就唆使学生闹事，有人在中央政治大学高喊：“同学们，请看老子任命儿子，要拿我们当孙子呀！”

　　“我们不当孙子！”

　　“反对儿子教育长！”

　　蒋介石知道后大怒，让蒋经国退出中央政治大学，但将这笔账记录在二陈头上，随时准备报复。1949年1月，蒋介石在南京被迫“下野”前召见有关人士，愤怒地说：“共产党没有打败我，都是自己人打败的。”然后手指陈立夫说：“就是你们这班人。”

　　cc系还不得美国人喜欢，当时的美国驻中国大使司徒雷登最讨厌二陈，多次在蒋介石面前透露美国讨厌二陈的意思。到台湾后，台湾安危与美国关系很大，为了照顾美国意思，蒋介石也决定对cc系开刀。