斯特（Georg Forster）领导下的傀儡政权美茵茨共和国。这些地区至今还留有法国占领时期的痕迹。法国在这些地区整顿了行政、司法和法律制度，废除了农奴制和封建等级。至今，法国与德国仍为莱茵河到底是“法国的边疆”还是“德国的河流”而争论不休。德法两国对萨尔（Saar）、阿尔萨斯（Alsace）和洛林地区（Lorraine）的争议持续不断，这种争议在后来的一个半世纪中一直影响着德法关系。

1801年签订的《吕内维尔条约》（Treaty of Lunéville）将莱茵河左岸割让给了法国，德国南部和西部的中小邦国遭到领地变更。围绕着帝国内部如何补偿这些邦国，1803年，帝国召开的一次议会通过了所谓的《全帝国代表会总决议》（Reichsdeputationshauptschluss），废除了大量先前独立的政治单元，或将它们并入大的领地中。就这样，约350个自由的帝国骑士和伯爵失去了领地，也失去了他们和皇帝的“直接”隶属关系。取消了112个政治单元，其中包括20个大主教区和教会诸侯领地，40个男修道院和女修道院，以及除了6个自由城市以外所有的自由城市。许多领主自然很高兴自己的领地又增加了，他们选择了无视拿破仑此举的真实目的—将自己赢得的德意志领地变为法国的殖民地。拿破仑脚踏欧洲的大片土地，于1804年秋称帝。奥地利的弗朗西斯二世（Francis Ⅱ）也在同一时间称帝，获得了“奥地利皇帝”的称号。于是，一些从拿破仑革命中受益的德意志小邦决定退出神圣罗马帝国，将自己置于法国的庇护之下。1806年7月，拿破仑创立了莱茵联邦（Rheinbund），由16个德意志邦国组成，其中包括巴伐利亚、符腾堡、巴登、黑森—达姆施塔特等，还在神圣罗马帝国外建立了华沙大公国。莱茵联邦实行《拿破仑法典》，并展开了包括废除农奴制在内的一系列改革。1806年8月6日，已经没有实际意义的神圣罗马帝国被正式废除。

1795年起，普鲁士一直保持中立。然而，1806年9月，腓特烈·威廉三世（Frederick William Ⅲ, 1797—1840）十分不明智地决定和法国宣战。普鲁士军队在18世纪晚期，由于几十年未进行改革，纪律涣散，又因准备不足，于1806年10月14日在耶拿战役中大败给了当时勇猛的法国军队。1807年《提尔西特条约》（Peace of Tilsit）签订，普鲁士易北河以西的土地全数归于法国，还搭上了东部的一些领土。此外，还须赔款，并为拿破仑后续的进军提供一些人马和资金。这次战败为普鲁士提供了一系列改革的机会和动力。

图19 1806年耶拿战役。出处：Weltgeschichte（Berlin: Ullstein, 1907—1909）。

普鲁士的一系列改革既不是单个的统一工程，也不是由关系密切、组成单一的革命者推动的。两个主要改革者的名字经常被一个误导人的连字符连起来，被称为是“施泰因—哈登贝格改革”（SteinHardenberg reforms，但其实两者的意见根本是互相冲突的）。一小部分改革者利用普鲁士战败的现状，试图将以前的改革计划付诸实践，而其他措施则是作为“防御性的现代化”方法来加以实施，或针对某些迫切的需求进行改革。这些措施主要集中在经济和军事领域。

1807年，农奴制被废除。因为农民一般无法付清补偿款，他们名义上的自由在实际中意义寥寥，主要的受益人还是贵族（最初的立法后来也被修订为偏向贵族）。“庄园”的概念使得出身，而非社会阶级决定了地位。一旦这个限制被打破后，贵族就可以进入中产阶级从事的行业，而农民和中产阶级就能（至少在理论上）购买贵族的地产。从等级社会到阶级社会的转变使劳动力的流动成为可能，为资本主义经济的发展奠定了基础。对后来的经济发展同样重要的还有协会限制权力的废除，以及内部贸易壁垒包括城市消费税的消除。不过，这时的经济改革只是局部改革，一些措施后来又被废除了。例如，1810年废除了贵族免税制度，但1819年又重新实施。另外，直到1848年，普鲁士贵族还一直对他们之前的农奴享有民事管辖权，直到1872年还有警卫特权，直到1891年还有一些行政特权。政治上，普鲁士政府进行了一定程度的现代化，其部门和内阁的工作效率提高了，但既没有宪法，也没有国民议会。城市可以自治，但农村不可以。法国令人震惊的军事胜利也引发了普鲁士的军队改革，并由沙恩霍斯特（Scharnhorst）、格奈森瑙（Gneisenau）和克劳塞维茨（Clausewitz）主导。1813年引入征兵制，建立了战时后备军（Landwehr），1814年通过了军队法。但改革还是没有完成。1815年后，征兵实际上并非面向全民。教育上，18世纪基础教育义务制得到了普及，职业技术中学和贵族的骑士学院也进行扩招。此外，普鲁士在这个时期还引入了精英中学—高级文理中学（