拉萨条约》上盖上了达赖喇嘛的印章。

此时有泰上奏朝廷，说「达赖喇嘛兵败潜逃，声名狼藉」，请求褫革达赖喇嘛的封号，由班禅额尔德尼来拉萨掌理宗教事务。清政府於是下令「将达赖喇嘛名号暂行革去，并着班禅额尔德尼暂摄」。

有泰同时将拉萨条约的内容报告给清廷，条约公布後广泛引起公愤，俄国也对英国在西藏独家牟利提出质疑。

于是清政府决定和英国商谈修改拉萨条约，赔款由清政府偿还。条约送北京，但清廷却坚持不在该约上签字。清政府派唐绍仪、张荫棠等赴印度同英方谈判，唐绍仪坚持中国对西藏的主权不容侵犯。

1903年12月，由于对噶厦政府拒绝执行中英藏印条约不满，英国军队再次侵入西藏。

6月，西藏政府发布征兵广告以回击英军。

刚接替裕钢驻藏大臣之职的有泰此时仍旧奉行妥协政策，对藏军进行多方约束和限制，向清政府提出「今欲折服其（西藏）心，非任其战任其败，终不能了局」。

七月初，英军占领江孜，达赖喇嘛感到败局已成，便派人与英人接触以阻止其进犯拉萨。

十三世达赖喇嘛於7月27日率亲信被迫途经青海逃往蒙古，临走前指定嘎丹墀巴罗桑坚赞为代理摄政。

但英军领帅麦克唐纳仍旧率军前进，7月7日，英军攻陷江孜宗山，七月底渡过雅鲁藏布江。